Graphvizメモ

• Graphviz 公式サイト
• Graphviz チュートリアル
• graphviz
• 下記２件はチュートリアルサイト．２００５年の文献だが，十分な情報が書かれている．

試しに小倉百人一首の歌をツリー構造で書きだしてみた

Graphvizとは†

• データをグラフに変換してくれるソフト
• グラフ，とはいわゆる連結グラフとか有向グラフと呼ばれる類のことで，棒グラフや円グラフのことではない
  • 棒グラフや直線グラフだったらGnuplotを使おう
• boostライブラリにも含まれてるので，C++のプログラムにも組み込み可能

グラフの書き方†

1. dot言語でグラフを記述する
2. Graphvizで処理する

dot言語の基本†

#geshi(dot,number){{ digraph sample {

 A -> B -> C;
 A[shape=circle,label="A"]
 B[shape=box,label="B"]
 C[shape=box,label="C"]

} }}

digraph†

• 有向グラフ
• ノードの連結には -> を使う

graph†

• おまじない

エラーなどなど†

Warning: xxxx.dot:xx: ambiguous "0x" splits into two names: "0" and "x"†

• ノードの名前に使えるのは英数字だけなのだが，最初の1文字はアルファベットでなくてはならない
• The name of the node can be consisted by alphabet and digit, but the first character must be an alphabet.&note{boost-graphviz:参考:Boost users' mailing page: [BGL] write_graphviz error};

Graphviz のツールの種類†

• Graphvizのツールの種類には様々な種類がある。
• 描きたいグラフに応じて使い分けるべき
  • dot:階層構造や、上限関係を記述するのに向いてるツール
  • neato:ノード間のエッジをバネモデルに基づき配置する
  • fdp:neato同様バネモデルで配置するが、力最小化でなく、エネルギー最小化にもとづき配置する
  • sfdp:fdpのノード大量版で使用するべきツール
  • twopi:同心円状に配置する。NTPのストラタムとか、DNSの階層構造を同心円状に書くのに向いてる。このツールだけは中心ノードを指定する必要がある
  • circo:円状にノードを配置する。ベンゼン環やTNTみたいな科学記号において、輪っかを綺麗に描くためのツール
• ギャラリー&note{graphviz-gallery:Gallery | Graphviz - Graph Visualization Software, 2013-02-08閲覧};

描画エンジン†

• pngなどを描く場合、cairo とか gd とか、描画ライブラリを選べる&note{graphviz-documentation:Command-line Invocation | Graphviz - Graph Visualization Software, 2013-02-08閲覧};

  -Tpng:cairo:gd

• といった具合に。
• でも、だいたいデフォルトと変わらない。

  -Tpng:

• とだけ指定すると、指定可能なオプションが列挙される

dot言語でレイアウトを崩したくない場合†

• レイアウトを崩したくない場合には constraint=false が便利
• 参考：rank - Subgraph layout in graphviz - Stack Overflow&note{rank-graphviz-dont-brake-layout-stack-overflow:rank - Subgraph layout in graphviz - Stack Overflow, 2012-09-17投稿, 2013-08-26閲覧};
• なお、透明な線で順序関係を描く場合は、color="white" ではなく、 style=invis が便利

Graphvizの参考ページ†

• Graphviz - mynote&note{reddog-graphgiz:Graphviz - mynote, 2005-09-13公開, 2012-10-23更新, 2014-12-01閲覧};
• graphviz&note{graphviz-emacs-wiki:graphviz, 2005-05-11更新, 2014-12-01閲覧};

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